Bien qu'elle n'ait à son grand dam aucune aptitude pour l'espionnage, Scarlett rêve de devenir agent secret et d'utiliser toutes sortes de gadgets incroyables comme le héros de son livre favori, le Top Agent 007. Pour s'exercer, elle décide de mettre sur pied sa propre agence, sous les moqueries de ses soeurs jumelles, Jiji et Lili, qui lui font remarquer qu'elle n'arrive même pas à les différencier! Elle peut heureusement compter sur l'aide de ses fidèles coéquipiers, à savoir Jimmy Bond, un ami secrtement amoureux d'elle, et de Spy, un garçon qui vient d'emménager dans le quartier. Le trio se fait ici embaucher par monsieur Pomme d'Api, un professeur de leur école, qui a égaré sa chaussette chanceuse et qui doit absolument la récupérer avant la rentrée scolaire, qui a lieu dans une semaine. Ayant découvert que ses deux acolytes sont amoureux d'elle, Scarlett décide de pimenter leur enquête en annonçant qu'elle récompensera celui qui aura résolu le mystère par une sortie officielle en sa compagnie. Ceci bien qu'elle ne songe pas un instant à avoir un petit ami pour l'instant. Or, il n'est pas facile de faire parler les indices récoltés quand on n'a aucune formation en science et en chimie! Ne reste qu'une solution: tendre un piège au voleur, qui fait bientôt d'autres victimes... Le chien qui les suit comme leur ombre aurait-il quelque chose à voir avec tout cela?