Dès le départ, on replonge dans le climat ténébreux et angoissant de la série. La guerre est terminée entre Créatures obscures et Chasseurs d'ombres, mais tout ne va pas bien. En effet, après les Accords nouvellement scellés, de nouveaux meurtres vont voir le jour. Des chasseurs d'ombres se font assassiner. Mais bonne nouvelle: Clary et Jace sont enfin ensemble et peuvent vivre leur idylle au grand jour. Tout comme son amoureux, Clary s'entraîne à devenir chasseur d'ombres. Les autres protagonistes, Simon, Luke, Jocelyne, Isabelle, Magnus, Alec et Maïa sont également de la partie. Mais les relations entre eux se transforment. Amour, haine et passion se mêlent sans arrêt entre tous les personnages. De nouveaux couples se forment, d'autres se défont. L'intrigue se passe surtout autour du gentil Simon. Il se retrouve à la rue lorsque sa mère découvre qu'il est un vampire. Mais tout le monde le veut - lui et ses pouvoirs - de son côté. Et ils ne reculeront devant rien pour l'obtenir. De petit terrestre insignifiant qu'il était, Simon est devenu un puissant vampire diurne convoité par les deux camps. Entre temps, Jace, obsédé par des cauchemars récurrents, semble prendre ses distances avec Clary.