Avril 1941. Encerclé et privé d'alliés sur le sol européen, le Royaume-Uni éprouve de plus en plus de difficultés à se ravitailler et voit ses bâtiments en provenance du Canada et des États-Unis systématiquement bombardés par les U-Boot allemands. Si ces derniers ne sont pas bientôt stoppés, c'en est fini de l'Angleterre! Supervisés par Charles Henderson, les jeunes recrues de CHERUB que sont Joël, Marc, Paul, PT, Rosie, Luc et Tristan se voient confier la dangereuse mission de gagner la France occupée et d'infiltrer la base de sous-marins implantée à Lorient. Le but? Percer à jour les projets allemands et définir leurs faiblesses afin d'organiser une opération de sabotage. grâce à l'intervention de Brigitte Mercier (une femme qui est à la tête d'un modeste réseau de résistance et de maisons closes), Joël et PT se font respectivement engager comme main-d'oeuvre dans les ateliers de maintenance des sous-marins et sur les chantiers de construction des blockhaus. Ceci alors que leurs acolytes sont chargés d'établir une base secrte de communication qui permettra de transmettre les informations récoltées à l'Angleterre. Si les Allemands ne sont pas aussi solides que leur propagande le laisse entendre, cette nouvelle mission réserve néanmoins de bien lourdes épreuves aux jeunes agents..