Les amateurs d'aventures sont ici invités à se glisser dans la peau de Nathan, un jeune garçon lambda qui se retrouve investi d'une mission extraordinaire: régler les petits problèmes quotidiens provoqués par les yo-kai, des esprits farceurs invisibles qui habitent une dimension parallèle, mais qui s'amusent à investir le monde des humains pour les empêcher de dormir, les placer dans des situations gênantes, les amener à faire de gentilles bêtises ou provoquer des conflits. Jusqu'à ce qu'on les aide à trouver la paix. Avec sa montre spéciale, Nathan peut heureusement les repérer et, lorsqu'il réussit à se lier d'amitié avec eux, il reçoit un médaillon lui permettant de les appeler à la rescousse en cas de besoin. Il peut heureusement compter sur l'aide de Whisper le spectre et du chat Jibanyan pour le seconder dans ses missions. Au lecteur d'effectuer les bons choix pour repérer les spectres et gagner de nouveaux médaillons...