Chaque été, Yacine et Coline passent leurs vacances chez leur tante Léna, qui travaille au musée des Confluences, à Lyon. Son métier consiste à prendre soin des précieux objets issus du monde entier qui y sont conservés, dont des ossements, des coquillages, des pierres ou des masques anciens. Ces derniers fournissent d'importants renseignements sur l'histoire de la Terre et de l'humanité, ce qui lui permet par la suite de répondre à toutes les questions que se posent sa nièce et son neveu curieux. En compagnie de Colibri, le drôle d'oiseau de Léna qui connaît lui aussi le musée par coeur, Yacine et Coline apprennent d'extraordinaires faits sur la naissance des étoiles, la formation des météorites, l'ordre des planètes de notre système solaire, le développement d'instruments de navigation, les débuts de la Terre, l'évolution des organismes vivants et les croyances des peuples primitifs.