Jonathan, frère de Jonas et fils aîné de la famille, menait une vit heureuse, jusqu'au jour de la catastrophe. Il parle de son père, de ses histoires abracadabrantes auxquelles lui, devenu trop grand, ne croit plus, mais qui impressionnent fortement Jonas. Il questionne son père sur les mathématiques et la physique. Ce dernier lui fait lire divers livres et lui transmet le goût d'apprendre. Jonathan, comme Jonas et Jog dans les deux romans précédents (##Le livre de Jog## et ##Mon père est une Jupi##), évoque le bonheur familial, les vacances d'été et de Noël. Et soudain la mauvaise nouvelle: papa est mort au cours d'une expérience qui a mal tourné. Alors que Jonas refuse de croire à cette mort ("Papa est parti sur Jupi"), Jonathan éprouve une grande tristesse et mesure l'ampleur de la perte. Cependant, il garde de son père un don certain pour les sciences. Ainsi, il est admis dans un prestigieux collège américain. Sa vie prend un nouveau tournant.