Paris, 1900. Jules Verne, de retour d'une expédition sur la Lune, ramène avec lui trois Sélénites: Myra, Passepartout et Oxyrhine. Or, en entrant dans l'atmosphère terrestre, ce dernier devient l'incarnation du Mal. Heureusement, Verne parvient à l'emprisonner dans une sphère de cristal, qu'il dissimule au sommet de la tour Eiffel avec la complicité de son créateur, tandis que Myra et Passepartout fondent une communauté sur les toits de Notre Dame de Paris. En 2169, le jeune collégien Louis Verne vient à peine d'obtenir confirmation que son ancêtre avait percé les secrets de la vie lunaire qu'il est contacté par les descendants de Myra et de Passepartout, qui réclament son aide afin de lutter contre Oxyrhine. Ce dernier a en effet réussi à se libérer quelques années plus tôt et a conclu un étrange pacte avec un homme d'affaires sans scrupules visant à coloniser la Lune, non sans avoir anéanti sa population...